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Python统计分析库statsmodels的OLS

Python 统计学-科学计算   2015-04-11 15:40:43


statsmodels库官方文档http://www.statsmodels.org/stable/,里面包含很多统计模型和相应计算结果;一些Linear Regression Models例子http://www.statsmodels.org/stable/examples/index.html#regression


下面主要陈述常用的回归分析中的OLS:Ordinary Least Squares。 

给定kk组样本数据(yi,x(i)1,x(i)2,⋯,x(i)n),i=1,2,⋯,k(yi,x1(i),x2(i),⋯,xn(i)),i=1,2,⋯,k, 

用n+1n+1维一次多项式回归模型 

y(x)=α0+α1x1+α2x2+⋯+αnxn=(α0,α1,⋯,αn)⎛⎝⎜⎜⎜⎜⎜⎜1x1x2⋮xn⎞⎠⎟⎟⎟⎟⎟⎟≜αTx

y(x)=α0+α1x1+α2x2+⋯+αnxn=(α0,α1,⋯,αn)(1x1x2⋮xn)≜αTx


其中α=(α0,α1,⋯,αn),x=(1,x1,x2,⋯,xn)Tα=(α0,α1,⋯,αn),x=(1,x1,x2,⋯,xn)T。

这里将常数项并入α,xα,x以增广形式表出是为了和statsmodels.OLS模块编写源码对应,OLS里的多项式回归模型是没有常数项的,所以这里将常数项看作基为11的维度上的系数,OLS就是用样本数据拟合出最小二乘最小的系数组合,即求αα。


对上述kk组样本数据进行最小二乘拟合,即最小化 

∑i=1k(yi−α0+α1x(i)1+⋯+αnx(i)n)2

∑i=1k(yi−α0+α1x1(i)+⋯+αnxn(i))2

statsmodels.OLS 的参数有endog, exog, missing, hasconst等 ,现在只考虑前两个。 

 

第一个输入 endog 是回归模型中的因变量y(x)y(x), 输入是一个kk维向量(y1,y2,⋯,yk)T(y1,y2,⋯,yk)T。第二个输入 exog 是自变量,即kk个样本点构成的k×(n+1)k×(n+1)维数组 

⎛⎝⎜⎜⎜⎜⎜11⋮1x(1)1x(2)1⋮x(k)1x(1)2x(2)2⋮x(k)2⋯⋯⋱⋯x(1)nx(2)n⋮x(k)n⎞⎠⎟⎟⎟⎟⎟

(1x1(1)x2(1)⋯xn(1)1x1(2)x2(2)⋯xn(2)⋮⋮⋮⋱⋮1x1(k)x2(k)⋯xn(k))


通常,我们使用的数据集的kk个样本点构成的数组第一列并不全是11,所以为了使用OLS模型函数,需要在数组左侧加上一列 1,就需要使用statmodels库的add_constant()函数,该函数的参数就是因变量数组(上述k×(n+1)k×(n+1)维数组去掉左侧一列11),也就是数据分析中用到的具有物理含义的list、pd.Series、pd.DataFrame;该函数的输出就如上述形式的k×(n+1)k×(n+1)维数组。

import pandas as pd # 读取数据到DataFrame
import urllib # 获取网络数据
import shutil # 文件操作
import zipfile # 压缩解压
import os

# 建立临时目录
try:
    os.system('mkdir bike_data')
except:
    os.system('rm -rf bike_data; mkdir bike_data')

data_source = 'http://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/00275/Bike-Sharing-Dataset.zip' # 网络数据地址
zipname = 'bike_data/Bike-Sharing-Dataset.zip' # 拼接文件和路径
urllib.request.urlretrieve(data_source, zipname) # 获得数据

zip_ref = zipfile.ZipFile(zipname, 'r') # 创建一个ZipFile对象处理压缩文件
#zip_ref.extractall(temp_dir) # 解压
zip_ref.extractall('bike_data')
zip_ref.close()

daily_path = 'bike_data/day.csv'
daily_data = pd.read_csv(daily_path) # 读取csv文件
daily_data['dteday'] = pd.to_datetime(daily_data['dteday']) # 把字符串数据传换成日期数据
drop_list = ['instant', 'season', 'yr', 'mnth', 'holiday', 'workingday', 'weathersit', 'atemp', 'hum'] # 不关注的列
daily_data.drop(drop_list, inplace = True, axis = 1) # inplace=true在对象上直接操作

daily_data.head() # 看一看数据~

import statsmodels.api as sm 
#最小二乘
from statsmodels.stats.outliers_influence import summary_table 
#获得汇总信息
x=sm.add_constant(daily_data['temp'])
#线性回归增加常数项 y=kx+b
y=daily_data['cnt']
regr=sm.OLS(y,x)
res=regr.fit() 

st, data, ss2 = summary_table(res, alpha=0.05) 
#置信水平alpha=5%,st数据汇总,data数据详情,ss2数据列名
fitted_values = data[:,2]  
#等价于res.fittedvalues

res.model.endog ==y.values  
#拟合回归模型的endog值就是因变量y

res.fittedvalues  #获取拟合y值

res.params  #拟合回归模型参数
res.params[0]+res.params[1]*daily_data['temp']==res.fittedvalues  #验证二维回归模型的拟合y值计算原理

# 总结下,常用的OLS模型模板

import statsmodels.api as sm # 最小二乘
from statsmodels.stats.outliers_influence import summary_table # 获得汇总信息
x = sm.add_constant(daily_data['temp']) # 线性回归增加常数项 y=kx+b
y = daily_data['cnt']
regr = sm.OLS(y, x) # 普通最小二乘模型,ordinary least square model
res = regr.fit()    #res.model.endog
# 从模型获得拟合数据
st, data, ss2 = summary_table(res, alpha=0.05) # 置信水平alpha=5%,st数据汇总,data数据详情,ss2数据列名
fitted_values = data[:,2]  #等价于res.fittedvalues

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The minute you think of giving up, think of the reason why you held on so long.